ZYGOMYCOTA: CARACTÉRISTIQUES, SYSTÉMATIQUE, ALIMENTATION, HABITAT - LA BIOLOGIE - 2025

Zygomycota est un groupe paraphylétique qui regroupe plus de 1 300 espèces de champignons aux origines évolutives différentes. Ceux-ci ont la caractéristique commune de produire des zygospores, qui sont des zygotes à parois épaisses et à parois dures, à travers lesquels se produit la reproduction sexuée.

Ce groupe est un assemblage de six lignées dont les relations restent à définir: Mucoromycotina, Entomophthoromycotina, Mortierellomycotina, Zoopagomycotina, Glomeromycota et Kickxellomycotina.

Sporangiospora mature de Mucor sp. Par Crédit photo: Fournisseurs de contenu: CDC / Dr. Lucille K. Georg, via Wikimedia Commons

Les zygomycètes sont le groupe de champignons présentant la plus grande diversité écologique. Ils peuvent être des saprophytes dans des substrats tels que les fruits, le sol et le fumier, des symbiotes dans les viscères des arthropodes, des mutualistes dans les plantes qui forment des mycorhizes et des agents pathogènes des animaux, des plantes, des insectes et d'autres champignons.

Dans l'industrie alimentaire, diverses espèces sont utilisées dans la fermentation des aliments. Rhizopus oligosporus est utilisé dans la préparation du tempeh de base d'Indonésie, un aliment fermenté dérivé du soja.

Rhizopus oryzae est utilisé dans la production de boissons alcoolisées, en Asie et en Afrique. Actinomucor elegans est utilisé dans la préparation du tofu, un aliment à base de soja courant dans la cuisine orientale. Ils sont également utilisés comme attendrisseurs de viande, colorant jaune pour la margarine, entre autres.

En revanche, certaines espèces ont un impact économique négatif. Rhizopus stolonifer et les espèces du genre Mucor provoquent la pourriture des fruits, en particulier des fraises.

Choanephora cucurbitarum est un phytopathogène qui provoque la pourriture des fruits et des fleurs de diverses cucurbitacées. Les espèces du genre Mucorales provoquent des infections opportunistes potentiellement mortelles chez les patients diabétiques, immunodéprimés et immunodéprimés.

Caractéristiques générales

Mucoromycotina est le clade le plus grand et le plus connu. Il comprend environ 300 espèces, communes dans tous les sols. Ils peuvent infecter les plantes et autres champignons. Ils ont été isolés dans des échantillons cliniques. Ils sont utilisés dans la fermentation des aliments.

Les différentes lignées qui composent le Zygomycota ont des caractéristiques générales différentes.

Entomophthoromycotina est le deuxième plus grand groupe de zygomycètes avec environ 300 espèces. Comprend les zygomycètes saprotrophes et entomopathogènes, les zygomycètes associés au sol et aux déchets. Ils peuvent être saprotrophes, pathogènes facultatifs et entomopathogènes obligatoires. C'est probablement l'un des premiers groupes de champignons terrestres.

Mortierellomycotina abrite plus de 100 taxons d'organismes saprotrophes du sol. Toutes les espèces de ce sous-embranchement sont des habitants du sol et des saprotrophes omniprésents, certains d'entre eux sont également des symbiotes végétaux.

Glomeromycota comprend plus de 250 espèces décrites qui ne peuvent pousser que sur les racines de plantes hôtes formant des mycorhizes arbusculaires. Il existe des fossiles anciens d'environ 430 millions d'années de morphologie remarquablement similaire à celle observée chez les champignons modernes.

Kickxellomycotina et Zoopagomycotina comprennent environ 180 espèces dans chaque sous-embranchement. Beaucoup de ces champignons sont des parasites d'invertébrés, d'arthropodes commensaux ou de saprotrophes. Certains d'entre eux sont importants comme agents pathogènes des insectes ravageurs.

Systématique

Le système des champignons est en cours de réorganisation. La classification traditionnelle des champignons était basée uniquement sur des caractéristiques morphologiques et physiologiques qui ne reflètent pas nécessairement l'histoire évolutive.

La classification moderne des champignons est basée principalement sur des groupes définis par des similitudes dans leurs séquences d'ADNr.

Cette nouvelle méthode a transformé les systèmes de classification traditionnels. Une étude de 2017 a reconnu huit phylums fongiques, tandis qu'un an plus tard, une autre étude a délimité neuf sous-règnes et au moins 18 phylums. De même, les relations au niveau de la famille, du genre et de l'espèce ne sont pas encore résolues.

Ainsi, les interrelations entre les espèces regroupées dans Zygomycota sont actuellement à l'étude. Il est reconnu qu'il s'agit d'un groupe artificiel, d'origine paraphylétique, qui ne constitue pas actuellement un taxon valide.

Ce groupe est un assemblage des taxons Mucoromycotina, Entomophthoromycotina, Mortierellomycotina, Zoopagomycotina, Mucoromycotina, Glomeromycota et Kickxellomycotina.

Nutrition

Les champignons sont hétérotrophes, ils se nourrissent de nutriments qu'ils absorbent de l'environnement. Les zygomicotes peuvent être des symbiotes saprotrophes, parasites ou mutualistes, selon leur mode d'alimentation.

Les zygomycètes saprotrophes se nourrissent de déchets d'autres organismes, tels que des matières végétales mortes (feuilles, bûches, écorces), des carcasses ou des excréments.

Les champignons produisent des enzymes qui sont exsudées dans l'environnement environnant et accélèrent la décomposition de la matière organique et la libération de nutriments dans l'environnement. Une partie de ces nutriments est absorbée par les champignons et une autre partie est utilisée par les plantes et autres organismes.

Les champignons parasites absorbent leur nourriture de la décomposition des tissus vivants de leur hôte, provoquant la mort dans la plupart des cas.

Les champignons qui établissent des relations symbiotiques mutualistes se nourrissent de produits excrétés par leur commensal sans nuire à leur survie.

Les espèces de champignons qui forment les mycorhizes se nourrissent d'une source constante de glucides provenant de la plante. Alors que la plante bénéficie de la capacité accrue du champignon à absorber l'eau et les nutriments et à mobiliser les minéraux.

Habitat

Les zygomycètes ont été isolés principalement du sol, où ils colonisent rapidement toute source de glucides ou de protéines facilement dégradables.

Ils peuvent également être associés aux ordures, au fumier animal ou à la matière organique en décomposition.

Les espèces parasites habitent les viscères des insectes et dans les tissus des plantes, des animaux et d'autres champignons.

D'autres espèces peuvent coloniser les milieux hospitaliers ou nosocomiaux, devenant ainsi un grave problème de santé publique.

la reproduction

Les champignons de ce groupe présentent une reproduction sexuée et asexuée.

Les espèces de l'ordre des mucorales sont les plus connues parmi les zygomycotts en raison de leur importance dans le domaine médical. Les champignons de ce groupe se reproduisent sexuellement par des zygotes à paroi épaisse et à paroi dure, appelés zygospores. Celles-ci sont formées dans un zygosporange, après la fusion d'hyphes spécialisés appelés gamétanges.

Cycle de vie Mucor sp. Par M. Piepenbring (M. Piepenbring), via Wikimedia Commons

Les zygospores matures subissent une période de dormance obligatoire avant la germination. Cependant, chez la plupart des espèces, la production de zygospores est plus rare et les conditions nécessaires à leur formation et à leur germination restent inconnues.

La reproduction asexuée dans les muqueuses se produit par le biais d'une multi-chaîne dans laquelle des sporangiospores unicellulaires et non mobiles sont produites.

Les mucoraux produisent non seulement des sporangiospores sèches dispersées dans l'air, mais aussi des sporangiospores humides, moins sujettes à l'aérosolisation. C'est une caractéristique importante qui détermine son niveau de pathogénicité.

Zygomycose

Plus de 30 espèces de Zygomycota sont impliquées dans les infections humaines. Parmi eux, Mucorales est le plus abondant. Parmi les infections fongiques, les zygomycoses sont d'une gravité exceptionnelle, avec un taux de mortalité supérieur à 50%.

La principale voie d'accès des champignons zygomycètes au corps, chez l'homme, passe par les voies respiratoires. La première barrière que les spores rencontrent sont les cellules ciliées de l'épithélium respiratoire. Ceux qui avancent rencontrent des macrophages alvéolaires qui engloutissent et détruisent la plupart des spores.

D'autres formes d'infection surviennent par contamination de plaies ou traumatismes graves, par voie orale ou par des piqûres d'insectes.

Patients à risque accru d'infection

La plupart des infections surviennent chez les nouveau-nés, qui n'ont pas encore développé de mécanismes immunitaires adéquats, ou chez les hôtes immunodéprimés, les greffés et les patients diabétiques présentant une acidocétose incontrôlée et des taux de fer sérique élevés.

En outre, les patients recevant des corticostéroïdes, de la déféroxamine chez les patients dialysés, des médicaments immunosuppresseurs, une neutropénie, une malnutrition, une infection à cytomégalovirus et des plaies ou brûlures sont également des conditions qui augmentent la susceptibilité au développement de la zygomycose.

Les infections hospitalières ou nosocomiales peuvent être dues à des dispositifs médicaux contaminés, par exemple des systèmes de sacs de stomie, des bandages adhésifs, des abaisse-langue en bois, une pompe à perfusion d'insuline sous-cutanée, une dialyse péritonéale, des dispositifs intravasculaires. T

Elle peut également résulter d'une contamination lors de procédures médicales telles que des extractions dentaires, une anesthésie locale, une injection intramusculaire de corticostéroïdes, de vitamines et d'anticoagulants, un emballage nasal, une contamination du greffon et pendant la transplantation.

Il existe cinq manifestations cliniques principales de la zygomycose: rhinocérébrale, pulmonaire, gastro-intestinale, cutanée et disséminée:

Zygomycose rhinocérébrale

C'est la forme la plus courante chez les patients diabétiques hématologiques et neutropéniques. Les symptômes initiaux ne sont pas spécifiques, notamment des maux de tête, un état mental altéré, de la fièvre et un syndrome oculaire, un larmoiement, une irritation ou une anesthésie périorbitaire.

Les troubles de la vision unilatérale et d'autres changements impliquant une ptose, une proptose ou une perte de la fonction musculaire extraoculaire sont des signes d'infection évoluant vers la région rétro-orbitaire ou le système nerveux central.

Zygomycose pulmonaire

La zygomycose pulmonaire survient généralement chez les patients atteints de neutropénie profonde, de cancers hématologiques, de corticostéroïdes ou de diabétiques. Les symptômes ne sont pas spécifiques et comprennent la fièvre, des douleurs thoraciques et la toux.

Zygomycose gastro-intestinale

C'est une forme d'infection très rare. Elle est associée à une malnutrition sévère et à un accouchement prématuré. On pense que l'infection est une conséquence de l'ingestion de champignons.

Les symptômes ne sont pas spécifiques et comprennent la fièvre, la douleur, les vomissements, la diarrhée et la constipation. L'infection peut entraîner un infarctus ischémique et une ulcération.

Zygomycose cutanée

L'infection se développe chez les patients qui ont subi des brûlures ou d'autres traumatismes. Elle est causée par l'inoculation directe lors d'un accident ou elle peut être nosocomiale.

La manifestation de la maladie implique un érythème, du pus, la formation d'abcès, une inflammation des tissus, une nécrose et une douleur dans la zone infectée.

La nécrose tissulaire peut évoluer vers une cellulite gangréneuse. L'infection cutanée peut être secondaire chez les patients présentant une infection des voies respiratoires disséminée.

Zygomycose disséminée

Une infection est considérée comme diminuée lorsque deux organes non contigus ou plus sont impliqués. Cette forme est la plus difficile à contrôler et constitue la plus grande menace pour le patient.

Ils incluent souvent la colonisation pulmonaire et du système nerveux central, le poumon étant le principal site d'infection. D'autres organes internes peuvent être secondairement envahis lors de la colonisation, y compris la rate, le foie et même le cœur, provoquant des douleurs dans l'organe infecté.

Références

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