ENTEROCOCCUS: CARACTÉRISTIQUES, MORPHOLOGIE, TAXONOMIE, PATHOGENÈSE - LA BIOLOGIE - 2025

Enterococcus est l'un des quatre genres de la famille des bactéries Enterococcaceae, appartenant à l'ordre des Lactobacillales, classe Bacilli du phylum Firmicutes. Ce genre regroupe une grande diversité de bactéries à Gram positif, de forme ovoïde ne formant pas de spores. Au moins 34 espèces sont reconnues dans ce genre.

Les bactéries du genre Enterococcus font partie de la flore intestinale de l'homme. Cependant, c'est un pathogène opportuniste, de plus en plus impliqué dans les infections nosocomiales ou hospitalières.

Enterococcus faecalis. Par le ministère de l'Agriculture des États-Unis, via Wikimedia Commons

Enterococcus faecalis est l'espèce la plus fréquemment isolée dans le matériel médical (80–90%), suivie d'Enterococcus faecium (8–16%). Des bactéries de ce genre ont également été isolées dans les aliments, les plantes, le sol et les eaux de surface, mais on pense que leur présence dans ces environnements est associée à une contamination fécale.

Les entérocoques sont des organismes extrêmement résistants, capables de vivre dans des environnements extrêmes. Ils peuvent pousser à des températures allant de 10 à 45 ºC. Ils supportent les environnements hypotoniques, hypertoniques, acides ou alcalins et peuvent se développer dans des atmosphères avec ou sans oxygène car ils sont anaérobies facultatifs. Ils sont très résistants à la déshydratation.

Certaines espèces d'entérocoques peuvent créer une résistance aux antibiotiques, ce qui en fait un problème de santé publique. L'Organisation mondiale de la santé inscrit Enterococcus faecium sur une liste d'agents pathogènes prioritaires pour la recherche et le développement de nouveaux antibiotiques, en raison de sa résistance inquiétante à la vancomycine.

Les entérocoques ont été utilisés comme probiotiques dans les denrées alimentaires et les aliments pour animaux, mais cette utilisation est controversée car ce sont des agents pathogènes potentiels liés aux maladies humaines et en raison des risques de transfert de gènes de résistance aux antimicrobiens et de virulence à des souches humaines.

Caractéristiques générales

Métabolismes

Les bactéries du genre Enterococcus sont facultativement anaérobies, avec une préférence pour les atmosphères anaérobies.

Physiologiquement, elles sont pour la plupart négatives à la catalase, bien que certaines souches révèlent une activité pseudocatalase lorsqu'elles sont cultivées dans des milieux contenant du sang. L'activité hémolytique est variable et dépend largement de l'espèce.

La température de croissance optimale pour la plupart des espèces se situe entre 35 et 37 ° C, bien que de nombreuses espèces puissent croître entre 42 et 45 ° C et très lentement à 10 ° C. Ils sont capables de survivre à 60 ° C pendant 30 minutes.

Ils sont chimioganotrophes, avec des besoins nutritifs généralement complexes. Ces bactéries peuvent tirer leur énergie de l'oxydation de composés inorganiques réduits tels que l'ammoniac, le soufre élémentaire, l'hydrogène, les ions fer, le nitrite et le soufre. Par conséquent, ils peuvent obtenir tout leur carbone cellulaire du dioxyde de carbone, et ils peuvent se développer sans aucun composé organique et sans lumière.

Les bactéries du genre Enterococcus ont un métabolisme fermentaire, pouvant fermenter une grande variété de substrats. La principale voie de production d'énergie est la formation homofermentaire d'acide lactique principalement à partir du glucose. Dans des conditions aérobies, le glucose est métabolisé en acide acétique, acétoïne et CO ₂.

Certaines espèces sont dépendantes du CO ₂ (carbophile).

Morphologie

Les bactéries du genre Enterococcus sont des cellules de forme ovoïde et peuvent mesurer de 0,6 à 2,0 microns sur 0,6 à 2,5 microns. Ils sont sessiles mais certaines souches peuvent avoir des flagelles courts qui leur donnent une certaine mobilité.

Les cellules se produisent seules ou par paires, parfois en chaînes courtes, souvent allongées dans le sens de la chaîne. En fonction de l'espèce, de la souche et des conditions de culture, les cellules filles peuvent être séparées, de sorte que la culture semble être composée de cellules uniques et de paires de cellules en division lorsqu'elle est vue par microscopie à contraste de phase.

Dans d'autres cas, les cellules filles peuvent rester attachées les unes aux autres, montrant ainsi des chaînes de cellules.

Taxonomie

Les membres du genre Enterococcus ont été classés dans le genre Streptococcus jusqu'en 1984, date à laquelle les résultats de l'analyse de l'ADN génomique ont indiqué qu'une classification distincte du genre serait appropriée.

Par la suite, l'existence de groupes au sein des espèces du genre a été établie, qui associent des espèces ayant des caractéristiques phénotypiques similaires, qui sont très difficiles à différencier les unes des autres.

Certains d'entre eux peuvent avoir 99,8% de séquences de gènes similaires. Cependant, ceux-ci peuvent être identifiés par des déterminations de similarité ADN-ADN et par certaines méthodes moléculaires.

Pathogénie

Les entérocoques ont un faible potentiel pathogène chez les personnes en bonne santé, cependant, ils constituent des agents pathogènes opportunistes chez les patients âgés, les nourrissons et les personnes immunodéprimées.

Malgré leur faible pouvoir pathogène, les Enterococcus sont de plus en plus impliqués dans les infections nosocomiales ou hospitalières. Ainsi, ces bactéries ont été considérées parmi les principales causes d'infections nosocomiales, étant responsables de plus de 10% des infections contractées dans les hôpitaux.

La pathogénicité des bactéries Enterococcus est médiée par leur forte capacité d'adhésion aux cellules hôtes et leur invasion ultérieure dans les tissus, par leur degré élevé de résistance aux conditions défavorables et enfin, par leur potentiel à créer une résistance aux antibiotiques et Facteurs de virulence.

Infections humaines

Des bactéries du genre Enterococcus ont été impliquées dans des infections humaines principalement dans les voies urinaires, le sang, le cœur et les plaies, bien qu'elles aient été isolées avec moins de fréquence dans des infections des voies respiratoires, du système nerveux central, des otites, des sinusites, des arthrites septiques, des endophtalmies et des brûlures..

Ces bactéries ont également été identifiées comme une cause d'infections chez la volaille et d'autres espèces animales, en particulier dans la septicémie, l'ostéomyélite et l'endocardite.

La résistance

Les entérocoques sont intrinsèquement résistants au chloramphénicol, aux tétracyclines, aux macrolides, aux lincosamides, aux streptogramines, aux quinolones, aux aminosides, aux β-lactames et aux glycopeptides.

Ces bactéries acquièrent une résistance aux antibiotiques grâce à des éléments d'ADN extrachromosomiques (plasmides, transposons). La résistance à la vancomycine est un problème sérieux, en particulier en milieu hospitalier, car il s'agit de l'antibiotique le plus puissant, utilisé en dernier recours pour traiter les infections bactériennes qui ne répondent à aucun autre antibiotique.

Le traitement des infections causées par la bactérie Enterococcus dépend de la sensibilité des souches. Ainsi, il est possible de traiter certaines souches sensibles avec de l'ampicilline, de la pénicilline et de la vancomycine.

La nitrofurantoïne peut également être utilisée, même en cas de résistance à la vancomycine, pour traiter les infections des voies urinaires.

Utilisations alimentaires

Les entérocoques sont des bactéries lactiques, c'est pourquoi ils ont été utilisés dans l'industrie alimentaire comme fermenteurs et comme probiotiques chez les animaux et les humains. Cependant, son utilisation dans les aliments est controversée en raison des qualités pathogènes de ces bactéries.

Ces aliments sont administrés pour traiter la diarrhée, le syndrome du côlon irritable, pour abaisser le taux de cholestérol ou pour améliorer le système immunitaire de l'hôte.

Chez les animaux, ces probiotiques sont principalement utilisés pour traiter ou prévenir la diarrhée, pour une stimulation immunitaire ou pour améliorer la croissance.

Du point de vue de la microbiologie alimentaire, la sécurité des bactéries utilisées comme probiotiques doit être garantie. Les données sur les principales souches utilisées jusqu'à présent indiquent qu'elles sont sûres.

Références

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