Les Enterobacteriaceae sont un groupe complexe et diversifié de micro-organismes. Ils portent le nom de leur emplacement fréquent dans le tube digestif des mammifères - y compris les humains - et d'autres animaux, comme les insectes (Tortora et al. 2007).
Cependant, la présence de ces bactéries n'est pas limitée au monde animal, elles ont également été trouvées comme pathogènes dans les plantes (Cabello, 2007), le sol et même dans l'eau (Olivas, 2001).
Escherichia coli
Selon la terminologie technique, ils sont considérés comme des «bacilles», un terme qui désigne la forme de barre allongée, droite et mince de ces organismes. De plus, ce sont des bactéries à Gram négatif, ce qui indique que leur paroi cellulaire est mince et dotée d'une double membrane riche en différents types de lipides (Tortora et al. 2007).
D'un point de vue clinique, certaines espèces d'entérobactéries provoquent des maladies chez l'homme, elles ont donc été étudiées de manière exhaustive. Cependant, tous ne sont pas pathogènes.
Par exemple, Escherichia coli est l'un des habitants les plus courants de l'intestin des mammifères, et certaines souches sont bénéfiques. En fait, E. coli est capable de produire des vitamines et d'exclure d'autres micro-organismes nocifs de l'intestin (Blount, 2015).
Caractéristiques générales
Les entérobactéries sont des bactéries vivantes, elles ne forment pas de spores et sont de taille intermédiaire, mesurant de 0,3 à 6,0 µm de longueur et 0,5 µm de diamètre. La température optimale pour sa croissance est de 37 ° C. Ils sont anaérobies facultatifs, c'est-à-dire qu'ils peuvent vivre dans des environnements avec de l'oxygène ou s'en passer.
Certains ont des flagelles (une projection qui ressemble à un fouet et est utilisée pour le mouvement), tandis que d'autres n'ont pas de structures de locomotion et sont totalement immobiles.
En plus des flagelles, ces bactéries ont généralement une série d'appendices plus courts appelés fimbriae et pilis. Bien que l'apparence des deux ressemble à un cheveu, leurs fonctions diffèrent.
Les fimbriae sont des structures utilisées pour adhérer à la muqueuse, tandis que les pili sexuels permettent l'échange de matériel génétique entre deux organismes, servant en quelque sorte de pont à ce processus (Tortora et al. 2007).
S'il est vrai que les bactéries ne subissent pas de reproduction sexuée, cet événement permet l'échange d'ADN. Cette nouvelle molécule d'ADN acquise par la bactérie receveuse lui permet de développer certaines caractéristiques, comme la résistance à un antibiotique particulier.
Ceci est connu sous le nom de transfert horizontal de gènes, est courant dans la plupart des bactéries et a des implications médicalement pertinentes.
Il est typique de certaines entérobactéries d'être entourées d'une couche supplémentaire composée de polysaccharides. Cela s'appelle une capsule et contient les antigènes K (Guerrero et al., 2014).
Classification
La famille des Enterobacteriaceae comprend environ 30 genres et environ plus de 130 espèces, biogroupes et groupes entériques. Cependant, le nombre peut varier légèrement selon l'auteur qui a établi l'ordre taxinomique.
La classification de ces micro-organismes est basée sur la détermination de la présence ou de l'absence de certaines enzymes clés appartenant à différentes voies métaboliques. De même, d'autres principes sont inclus pour établir l'ordre du groupe, tels que: réactions sérologiques, sensibilité ou résistance à certains antibiotiques.
Historiquement, la catégorie taxonomique de la tribu a été utilisée dans la classification des entérobactéries. Cela comprenait les tribus Escherichieae, Edwardsielleae, Salmonelleae, Citrobactereae, Klebsielleae, Proteeae, Yersinieae et Erwiniaeae.
Cependant, selon différents auteurs, ce point de vue est déjà obsolète et a été écarté. Malgré ce changement, la taxonomie de ce groupe a fait l'objet de débats ardus (Winn, 2006).
Ces dernières années, les techniques de séquençage et d'hybridation de l'ADN ont permis d'établir une classification plus précise des organismes qui composent cette famille hétérogène.
Dans la classification et la nomenclature des Enterobacteriaceae, les genres les plus importants du groupe peuvent être mentionnés: Escherichia, Shigella, Klebsiella, Yersinia, Enterobacter, Serratia, Hafnia, Proteus, Morganella, Providencia, Citrobacter, Edwardsiella et Salmonella.
Tests biochimiques
Les tests biochimiques sont essentiels en laboratoire pour identifier les agents pathogènes chez l'homme ainsi que dans le sol et les aliments. La réponse des micro-organismes à différentes réactions biochimiques donne une caractéristique qui facilite leur typage.
Les caractéristiques les plus importantes du métabolisme de cette famille de bactéries comprennent:
-La capacité à réduire les nitrates en nitrites, un processus appelé dénitrification (il existe quelques exceptions telles que Pantoea agglomerans, Serratia et Yersinia).
-Capacité à fermenter le glucose.
-Négativité au test oxydase, positive au test catalase, et ni pectate ni alginate liquéfié (Gragera, 2002; Cullimore, 2010; Guerrero et al., 2014).
- De même, certaines entérobactéries pathogènes ne fermentent pas le lactose.
Parmi les tests les plus courants pour l'identification de ces micro-organismes sont: la production d'acétyl-méthyl-carbinol, le test du rouge de méthyle, la production d'indole, l'utilisation de citrate de sodium, la production d'acide sulfurique, l'hydrolyse de la gélatine, l'hydrolyse de l'urée et la fermentation du glucose, du lactose, du mannitol, du saccharose, de l'adonitol, du sorbitol, de l'arabinose, entre autres glucides (Winn, 2006; Cabello, 2007).
Les tests considérés comme les plus puissants pour discerner l'identité des bactéries sont: la production d'indole, la lysine décarboxylase, l'H2S et l'ornithine décarboxylase (García, 2014).
épidémiologie
Les entérobactéries sont les agents responsables de diverses pathologies. Les infections des voies urinaires, la pneumonie, la septicémie et la méningite sont parmi les plus courantes. Bien que la production de l'infection dépende principalement de l'état du système immunitaire du patient.
Parmi les genres d'entérobactéries médicalement importantes, les plus pertinents sont:
-Salmonella: elle est transmise par des aliments ou de l'eau contaminés et provoque de la fièvre, de la diarrhée et des vomissements.
-Klebsiella: elle est associée à des infections urinaires, des diarrhées et des abcès et des rhinites.
-Enterobacter: il est associé à la méningite et à la septicémie.
Serratia: il provoque une pneumonie, une endocardite et une septicémie.
Certains genres de Proteus provoquent une gastro-entérite.
Citrobacter provoque des infections urinaires et respiratoires chez les patients malades.
Traitements
Le traitement de ces bactéries pathogènes est assez complexe et dépend d'une grande variété de facteurs, tels que la situation initiale du patient et les symptômes que cela manifeste.
Les entérobactéries, agents nocifs, sont généralement sensibles à certains antibiotiques tels que: les quinolones, l'ampicilline, les céphalosporines, l'amoxicilline-acide clavulanique, le cotrimoxazole et certains sont sensibles à la tétracycline.
Il convient de noter que l'utilisation aveugle d'antibiotiques augmente la fréquence des bactéries qui leur résistent. Ceci est considéré comme un problème de santé mondial délicat et, logiquement, entrave l'attribution du traitement.
Par exemple, le fait que certaines entérobactéries soient résistantes aux carbapénémases entrave considérablement les traitements, et la solution viable la plus simple consiste à appliquer un traitement combinant plusieurs antibiotiques (Falagas et al., 2013), comme la tigécycline et la colistine (Guerrero et al., 2014).
Des recherches récentes suggèrent l'utilisation d'aminosides, de polymyxines, de fosfomycine et de témocilline (Van Duin, 2013).
Références
- Blount, ZD (2015). L'histoire naturelle des organismes modèles: le potentiel inépuisé d'E. Coli. Elife, 4 ans, e05826.
- Cabello, RR (2007). Microbiologie humaine et parasitologie. Bases étiologiques des maladies infectieuses et parasitaires. Éducation médicale panaméricaine
- Cullimore, DR (2010). Atlas pratique pour l'identification bactérienne. CRC Press.
- Falagas, ME, Lourida, P., Poulikakos, P., Rafailidis, PI, et Tansarli, GS (2013). Traitement antibiotique des infections dues aux entérobactéries résistantes aux carbapénèmes: évaluation systématique des preuves disponibles. Agents antimicrobiens et chimiothérapie, AAC-01222.
- García, P. et Mendoza, A. (2014). Tests biochimiques traditionnels et à haute résolution pour l'identification manuelle des entérobactéries. Acta biochimique clinique d'Amérique latine, 48 (2), 249-254.
- Gragera, BA (2002). Infections entérobactériennes. Programme de formation médicale continue accrédité en médecine, 8 (64), 3385-3397.
- Guerrero, PP, Sánchez, FG, Saborido, DG et Lozano, IG (2014). Infections entérobactériennes. Programme de formation médicale continue accrédité en médecine, 11 (55), 3276-3282.
- Olivas, E. (2001). Manuel de base du laboratoire de microbiologie. Programme d'entraînement sportif. UACJ.
- Tortora, GJ, Funke, BR et Case, CL (2007). Introduction à la microbiologie. Panamerican Medical Ed.
- Van Duin, D., Kaye, KS, Neuner, EA et Bonomo, RA (2013). Entérobactéries résistantes aux carbapénèmes: examen du traitement et des résultats. Microbiologie diagnostique et maladies infectieuses, 75 (2), 115-120.
- Winn, WC (2006). Atlas des couleurs et manuel de microbiologie diagnostique de Koneman. Lippincott Williams et Wilkins.