COLLETOTRICHUM: CARACTÉRISTIQUES, TAXONOMIE, MORPHOLOGIE - LA BIOLOGIE - 2025

Colletotrichum est un genre de champignons du sac (Ascomycota) avec un grand nombre d'espèces. Ils sont mondialement reconnus comme agents pathogènes de nombreuses plantes sauvages et de la plupart des espèces végétales cultivées. Ces organismes attaquent les cultures dans les régions tropicales et subtropicales, causant des pertes de plusieurs millions de dollars à l'agro-industrie.

Les champignons du genre Colletotrichum sont responsables de la pourriture des fruits après la récolte, de l'anthracnose et de la brûlure sur les plantes commercialement importantes, notamment les bananes, les papayes, le manioc, le sorgho, le café, les haricots, la tomate, les piments, et bien d'autres.

Colletotrichum gloeosporoides. Tiré et édité de

La classification taxonomique des espèces de Colletotrichum est controversée et est actuellement en cours de révision. Certaines caractéristiques morphologiques sont utiles pour différencier des groupes d'espèces mais ne sont pas utiles dans d'autres cas.

Il a été suggéré que le genre Colletotrichum contiendrait des complexes d'espèces cryptiques étroitement liées les unes aux autres, avec un comportement de colonisation et d'infection similaire.

caractéristiques

Colletotrichum fait partie du groupe des champignons ascomycètes. Ces organismes se caractérisent par la présentation d'une structure reproductrice en forme de sac. Son mycélium est constitué d'hyphes cloisonnés.

Parmi les autres caractéristiques des ascomycètes en général, et du Colletotrichum en particulier, sont:

Reproduction asexuée par les conidiospores

La reproduction sexuée implique toujours la production d'un asque avec au moins deux ascospores haploïdes. Ils tolèrent des températures comprises entre 10 et 40 ° C, mais leur température optimale de développement est de 28 ° C.

Au cours du processus d'infection, les espèces phytopathogènes du genre Colletotrichum colonisent dans un premier temps les cellules vivantes de la plante, brisant la paroi cellulaire, mais sans pénétrer la membrane plasmique de ces cellules (cela empêche la mort cellulaire progressive).

Le début de l'alimentation des parties mortes de la plante par le champignon est associé à des changements morphologiques, génétiques et physiologiques notables de cette dernière. Ces modifications du champignon provoquent une mort cellulaire massive et la destruction des tissus de l'hôte.

Anthracnose causée par Colletotricum sp. Tiré et édité de

Taxonomie

Le genre Colletotrichum, a été érigé par Corda en 1831, pour décrire l'espèce C. lineola, à partir de matériel collecté à Prague (République tchèque) à partir de la tige d'une plante herbacée non identifiée de la famille des Apiacées.

Actuellement, bien que le genre Colletotrichum soit considéré comme valide, la définition des différentes espèces est controversée et sujette à révision.

Certaines espèces de ce genre sont confondues avec des espèces du genre Gleosporium, cependant ces dernières ne produisent pas de champignons dans les acervules.

Identification taxonomique des espèces de

Morphologique

L'identification basée sur les caractéristiques morphologiques des champignons Colletotrichum est possible chez certaines espèces en fonction de l'hôte auquel ils sont associés, de la croissance mycélienne, de la capacité de sporulation et des caractéristiques particulières des conidies, des appressorias et des sclérotes.

Pour cela, il est nécessaire de réaliser des cultures artificielles du champignon et d'observer la germination des conidies.

Moléculaire

Les caractéristiques morphologiques et la gamme d'hôtes ont traditionnellement été utilisées pour définir les espèces fongiques. L'utilisation excessive et inappropriée du type d'hôte pour la détermination des espèces a conduit à la prolifération de noms scientifiques inutiles.

Cela peut être dû, en partie, au fait que les espèces végétales ayant une large distribution spatiale peuvent être affectées par différentes espèces de champignons. Le fait que certaines espèces de Colletotrichum peuvent s'associer à une seule espèce végétale, tandis que d'autres peuvent s'associer à plus d'un hôte, contribue également à cela.

En raison de ce qui précède, la biologie moléculaire en tant qu'outil a fourni de nouvelles connaissances sur la systématique de ce groupe de champignons, en particulier dans la délimitation des espèces et la définition des relations inter et intraspécifiques.

La région d'espacement interne transcriptible de l'ARN ribosomal (ITS) est la région la plus couramment utilisée pour différencier les champignons. Cette région s'est avérée peu utile pour différencier les espèces de Colletotrichum.

La phylogénie multi-locus a été largement appliquée pour identifier les espèces de ce genre. En utilisant cette méthodologie, il a été suggéré que C. gloeosporioides est en fait un complexe composé de 23 taxons. Au moins 19 nouvelles espèces ont également été décrites sur la base de la phylogénie à locus multiples.

Autres outils

D'autres outils suggérés pour aider à élucider l'identité des espèces de Colletotrichum ont été des analyses biochimiques et physiologiques.

Morphologie

Lorsque Corda, en 1831, décrivit la première espèce du genre Colletotrichum (C. lineola), il mentionna que cette espèce forme des acervules linéaires en forme de fuseau, ils présentent un aspect courbe, avec des conidies hyalines aux extrémités pointues et brunes, de tonalité opaque, avec des soies subspatulate et pointes acérées.

En général, les champignons du genre Colletotrichum possèdent des organes de fructification asexués en forme de coussin, fermés, en setosus, situés sur ou près de l'épiderme, qui s'ouvrent irrégulièrement.

Le stroma basal est d'épaisseur variable, de brun foncé à incolore ou presque incolore. Les cellules basales du stroma sont polyédriques, presque du même diamètre et sans espaces entre elles.

Colonies cultivées d'espèces Colletotrichum sur PDA; C. gloeosporioides du groupe 1 (a); groupe 2 (b); groupe 3 (c); C. musae (d); C. truncatum (e). Tiré et édité de

Anthracnose causée par

Cette condition, également connue sous le nom de maladie des taches noires sur les feuilles, est produite par divers types de champignons. Parfois, il est difficile de déterminer le genre et l'espèce du champignon responsable d'attaques particulières.

L'anthracnose causé par Collecotrichum est très commun dans les plantes de pépinière et dans de nombreuses cultures. Cette maladie peut affecter les feuilles, les branches, les fleurs et les fruits. Les principales espèces de Collecotrichum responsables de l'anthracnose appartiennent au complexe d'espèces de C. gloeosporioides.

Les taches foliaires sont la cause la plus fréquente de pertes de production, dues à l'anthracnose causée par Colletotrichum dans les plantes de pépinière. La maladie peut également apparaître sous forme de brûlure sur les feuilles, de taches sur les tiges, les branches ou les fleurs, les chancres sur la tige et les branches ou la pourriture des fruits. L'expression des symptômes dépend fortement de l'espèce végétale infectée.

Le dommage économique produit par Colletotrichum dans les plantes est généralement le résultat de pertes dues à la pourriture du fruit au champ ou après la récolte. Cette maladie a causé des pertes de 17% des cultures de papaye, 30% de mangue et jusqu'à 50% des cultures de piment.

Références

1. S. Manners, S. Stephenson, H. Chaozu, DJ Maclean (2000). Transfert de gène et expression dans Colletotrichum gloeosporioides provoquant l'anthracnose sur Stylosanthes In: Colletotrichum spécificité de l'hôte, pathologie et interaction hôte-pathogène eds. Dov Prusky, Stanley Freeman et Martin B. Dickman St Paul, Minnesota éd. APS Press l'American Phytopathological Society.
2. M. Abang (2003). Diversité génétique de Colletotrichum gloeosporioides Penz. causant la maladie de l'anthracnose de l'igname (Dioscorea spp.) au Nigéria. Bibliotheca Mycologia.
3. M. Waller (1992). Maladies du Colletotrichum des cultures pérennes et autres cultures commerciales. Dans: Prusky, D., S. Freeman et M. Dickman (éds). Spécificité, pathologie et interaction hôte-pathogène du colletotrichum. Presse de la Société américaine de phytopathologie. St. Paul, Minnesota, États-Unis.

4. M. Waller et PB Bridge (2000). Avantages récents dans la compréhension des maladies du Colletotrichum de certaines cultures pérennes tropicales. À Colletotrichum: biologie, pathologie et contrôle. Bailey, J. et Jeger, M. Eds. CAB International.
5. D. De Silva, PW Crous, PK Ades, KD Hyde, PWJ Taylor (2017). Modes de vie des espèces de Colletotrichum et implications pour la biosécurité des plantes. Examens de la biologie fongique.
6. M. Prescott, JP Harley et GA Klein (2009). Microbiologie, 7e édition, Madrid, Mexique, Mc GrawHill-Interamericana. 1220 pp.
7. C. Han, XG Zeng et FY Xiang (2015). Répartition et caractéristiques de Colletotrichum spp. Associé à l'anthracnose de la fraise à Huebi, en Chine. Maladie des plantes.
8. CI Corda (1831). Die Pilze Deutschlands. Dans: Deutschlands Flora in Abbildungen nach der Natur mit Beschreibungen 3 (éd. J. Sturm). Abt., Tab. 21-32. Nürnberg; Sturm.
9. S. Wharton et J. Diéguez-Uribeondo (2004) La biologie de Colletotrichum acutatum. Annales du jardin botanique de Madrid.
10. R. Nag Raj (1993). Anamorphes coelomycètes avec conidies portant des appendices. Descriptions des taxons. Colletotrichum Corda. Récupéré de mycobank.org.
11. Comité de rédaction de WoRMS (2018). Registre mondial des espèces marines. Colletotrichum. Récupéré de www.marinespecies.org.